尊敬的CytoBuoy用户:
谨代表AqQua项目的负责人,特此提请您关注以下内容。
AqQua项目全称水生生物基金会项目(The Aquatic Life Foundation Project),是亥姆霍兹基金会模型计划中的一个试点项目。
每天,全球的研究人员都会获取数百万张浮游生物图像。每个独立的数据点承载着有关生物多样性、水生食物网功能以及相关水体生态系统状况的信息。
AqQua 项目将借助欧洲首台百亿亿次超级计算机,构建首个远洋成像基础模型,整合来自全球水生环境的数十亿张图像。
AqQua 将提供理解生物碳泵所需的关键数据,生物碳泵是一个自然过程,能从大气中封存大量碳,并对全球气候产生重大影响
他们诚挚邀请您参与AqQua项目——这是一项大规模协作计划,旨在:
- 构建浮游生物图像数据的AI基础模型;
- 将其作为开源工具向全球科研界发布,以助力各类浮游生物相关研究;
- 利用该模型开发全球浮游生物及颗粒物分布模型,并估算相关过程速率。
为实现这一目标,AqQua项目目前正收集来自全球不同水生环境中多种成像设备的浮游生物图像数据集。为整合出一套兼具多样性与广泛性的数据集,我们鼓励全球科学家分享各自的浮游生物及颗粒物图像数据。
令人欣喜的是,我们已收到大量支持响应,全球已有40多个学术实验室及非学术机构承诺共享数据并贡献专业力量。
所有共享数据的参与者都将被列为计划发表的数据论文的作者。此外,还将受邀积极参与基础模型论文、全球分布模型及过程速率估算相关论文的撰写。因此,即便您的数据已处于公共领域,我们仍希望与您取得联系。AqQua基础模型的性能很可能与其训练数据的类型密切相关,从长远来看,共享数据或将为您的研究带来助益。
AqQua项目秉持开放科学理念,所有共享数据需允许在2027年7月15日起以CC BY-NC 4.0许可协议公开发布(作为计划中数据论文的一部分)。因此,我们仅接收已公开或最迟可在2027年7月15日前公开的数据。
项目模型训练将于今年秋季启动,数据提交截止日期为2025年7月31日。如您有意参与,请阅读并填写我们的数据共享表格。表格将用于说明您所提供的数据内容、相关许可或协议,以及数据共享的技术方式。
如需了解更多关于AqQua项目的信息,请访问我们的项目页面。如有任何疑问或建议,欢迎随时通过邮箱aqqua@geomar.de与我们联系。我们热切期待您的加入!
此致
Rainer Kiko(AqQua团队代表)
项目负责人:Rainer Kiko, Dagmar Kainmueller, Klas Ove Möller, Timo Dickscheid
若您在EcoTaxa平台托管图像数据,我们是通过该平台公开的项目所有者列表获取您的联系方式的。现特向您询问是否愿意与我们共享您在EcoTaxa上的特定数据集。本项目得到了维拉弗朗什海洋实验室( Laboratoire d'Océanographie de Villefranche)同事的支持,但他们并非项目成员。
AqQua项目不会从EcoTaxa平台批量抓取图像,仅使用明确共享给我们的数据。如需从EcoTaxa向我们传输数据,最简便的方式是为EcoTaxa用户“AqQua”(邮箱:aqqua@geomar.de)提供“查看”权限。我们将通过EcoTaxa的API下载数据,下载完成后会及时通知您,您可根据需要修改或撤销权限。
仅项目负责人Rainer Kiko(邮箱:rkiko@geomar.de)和数据管理员Martin Schröder(邮箱:mschroeder@geomar.de)有权访问aqqua@geomar.de账户。
若您希望通过EcoTaxa的API批量修改多个项目的访问权限,欢迎使用我们的Python脚本(链接:https://codebase.helmholtz.cloud/aqqua-public/ecotaxa-tools)。